안녕하십니까? 한말연구학회입니다.

"가다"는 "~에/에게, ~을, ~으로, ~이" 등의 조사를 취할 수 있는 동사인데, 상황에 따라 선택하는 조사가 조금씩 다릅니다. 말씀하신 것처럼 (목적지)의 경우에 "~에 가다"라고 하는 것이 가장 자연스럽습니다.

학교에 가다
집에 가다
바다에 가다

반면에 다음과 같이 어떤 일을 하러 움직일 때는 "~을 가다"를 씁니다.

군대를 가다
등산을 가다
문병을 가다

물론, 두 개다 가능한 것처럼 보이는 경우가 있습니다.

학교에 가다 / 학교를 가다

그러나 "학교에 가다"는 "학교"라는 장소에 간다는 뜻으로, "학교를 가다"는 "입학하다"나 "등교하다"의 의미로 해석됩니다. 그러므로 "~에 가다"와 "~을 가다"는 문맥 의미를 잘 파악해서 구별해 쓰는 것이 좋습니다.