안녕하십니까? 한말연구학회입니다.

"-군요"나 "-네요"는 각각 종결어미 "-군"과 "-네"에 높임의 조사 "요"를 붙인 것이니 "-군"과 "-네"의 쓰임새의 차이를 비교하는 것이 우선이겠군요.
"-군"과 "-네"의 의미는 거의 비슷하기 때문에 말로 풀어 그 차이를 설명하기는 어렵습니다. 기본적으로 "-군"이나 "-네"는 "새로게 알게 된 사실에 대해 감탄의 뜻을 담아 표현하는 말입니다."

(1) 학교가 참 크군/크네
참 예쁘군/예쁘네

이 경우에 둘의 의미차이는 거의 없다고 보면됩니다.
그러나 "-군"과 달리 "-네"는 감탄의 뜻이 없이 단순한 서술의 기능을 하기도 합니다.

(2) 나 지금 가네.
여기는 눈이 많이 왔네

위의 경우에는 "-군"을 쓰지 않습니다. 그러나 (2)의 경우에는 "-요"를 붙여 "네요"라고는 쓰지 않습니다. 결국 "군요"나 "네요"의 의미를 가질 때는 (1)번처럼 사용할 때이므로 이때 의미차이는 거의 없습니다.